Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RAB3GAP1Q15042 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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RAB3GAP1Q15042 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB3GAP1Q15042 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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