Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPRCAPQ14761 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRCAPQ14761 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms