Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BECN1Q14457 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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