Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGB1Q14028 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGB1Q14028 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
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