Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTCH1Q13635 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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