Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPN13Q12923 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PTPN13Q12923 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPN13Q12923 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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