Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB40BQ12829 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms