Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBRQ0VD83 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms