Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DSC1Q08554 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms