Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1Q04771 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACVR1Q04771 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms