Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms