Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DSG1Q02413 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms