Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1DQ01668 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms