Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms