Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SKOR1P84550 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms