Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMF1P82094 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMF1P82094 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMF1P82094 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms