Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms