Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCE1P61221 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms