Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP153P49790 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP153P49790 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUP153P49790 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUP153P49790 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NUP153P49790 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms