Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms