Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA4P48169 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms