Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 LMF2-203ENST00000504717 1233 ntTSL 529.28■■■□□ 2.282e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.333e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.362e-12■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 NFE2L2-205ENST00000430047 451 ntTSL 325.43■■□□□ 1.661e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 217.48■□□□□ 0.391e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 510.26□□□□□ -0.771e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 56.61□□□□□ -1.351e-10■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)27.59■■■□□ 2.012e-17■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PRKRIP1-205ENST00000477886 986 ntTSL 1 (best)26.92■■□□□ 1.92e-17■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 525.63■■□□□ 1.692e-17■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-17■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-13■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-13■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 325.32■■□□□ 1.642e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.422e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.412e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 321.33■■□□□ 1.012e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 49.78□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 EPS8L2-222ENST00000532545 419 ntTSL 325.23■■□□□ 1.635e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 EPS8L2-225ENST00000533816 540 ntTSL 522.92■■□□□ 1.265e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 EPS8L2-217ENST00000530452 704 ntTSL 320.85■□□□□ 0.935e-6■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.392e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.82e-8■■■□□ 15.4
GTF2F1P35269 DZIP1-205ENST00000466027 1580 ntTSL 225.53■■□□□ 1.684e-14■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)25.42■■□□□ 1.665e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 524.2■■□□□ 1.465e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-210ENST00000470596 788 ntTSL 223.26■■□□□ 1.315e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-205ENST00000461465 480 ntTSL 418.56■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-14■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-221ENST00000495347 698 ntTSL 417.88■□□□□ 0.455e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.435e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-204ENST00000461106 1916 ntTSL 217.7■□□□□ 0.425e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 417.51■□□□□ 0.395e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-14■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 512.89□□□□□ -0.355e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 49.34□□□□□ -0.914e-14■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 PRKCZ-217ENST00000481140 713 ntTSL 47.74□□□□□ -1.175e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 SLC26A6-211ENST00000431739 588 ntTSL 316.53■□□□□ 0.242e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 415.84■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 210.41□□□□□ -0.746e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 516.32■□□□□ 0.25e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 515.62■□□□□ 0.095e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 314.84□□□□□ -0.035e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 SLC22A31-205ENST00000603735 791 ntTSL 318.52■□□□□ 0.566e-9■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.752e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.091e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FBXO17-207ENST00000601394 2366 ntTSL 516.69■□□□□ 0.261e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-204ENST00000434918 2674 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.181e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-201ENST00000360534 3904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-207ENST00000490286 2241 ntTSL 513.04□□□□□ -0.321e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-210ENST00000497461 781 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.381e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-202ENST00000413651 578 ntTSL 412.54□□□□□ -0.41e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-203ENST00000416189 527 ntTSL 57.54□□□□□ -1.21e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 DPP4-205ENST00000461836 672 ntTSL 1 (best)5.37□□□□□ -1.551e-10■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-215ENST00000452773 665 ntTSL 219.97■□□□□ 0.794e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-224ENST00000489087 512 ntTSL 419.52■□□□□ 0.724e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-210ENST00000430102 702 ntTSL 318.4■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-217ENST00000458177 1472 ntTSL 1 (best)15.4■□□□□ 0.064e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-211ENST00000433016 855 ntTSL 514.32□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-219ENST00000466166 545 ntTSL 414.32□□□□□ -0.124e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-205ENST00000412043 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.184e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-212ENST00000440209 557 ntTSL 413.14□□□□□ -0.314e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-213ENST00000444960 783 ntTSL 411.42□□□□□ -0.584e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-208ENST00000425073 546 ntTSL 410.61□□□□□ -0.714e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-216ENST00000454017 978 ntTSL 310.61□□□□□ -0.714e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-206ENST00000413688 551 ntTSL 410.6□□□□□ -0.714e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-204ENST00000394507 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.884e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-207ENST00000422347 483 ntTSL 58.03□□□□□ -1.124e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-209ENST00000425919 572 ntTSL 58.03□□□□□ -1.124e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 KRIT1-218ENST00000458493 507 ntTSL 47.17□□□□□ -1.264e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 SH2B3-203ENST00000550925 648 ntTSL 522■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.062e-6■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 225.5■■□□□ 1.679e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.539e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.349e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.279e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.079e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 320.29■□□□□ 0.849e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 220.03■□□□□ 0.89e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.669e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.329e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.39e-7■■■□□ 15.3
GTF2F1P35269 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.199e-7■■■□□ 15.3
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 334.3 ms