Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms