Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM5AP29375 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5AP29375 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms