Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VAMP1P23763 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VAMP1P23763 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms