Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRHP20396 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRHP20396 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRHP20396 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRHP20396 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRHP20396 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRHP20396 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRHP20396 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRHP20396 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRHP20396 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRHP20396 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRHP20396 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
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