Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms