Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL2P13500 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCL2P13500 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCL2P13500 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms