Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2C1P13056 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms