Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A1P11836 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms