Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGA3P0DJD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms