Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2BP0DI82 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms