Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4BP0C0L5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4BP0C0L5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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