Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX7O95931 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX7O95931 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX7O95931 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms