Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNKO75909 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms