Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPS6KA4O75676 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS6KA4O75676 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms