Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMUO75648 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRMUO75648 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms