Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms