Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP104O60308 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP104O60308 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP104O60308 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP104O60308 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP104O60308 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP104O60308 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms