Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms