Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C5orf58C9J3I9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms