Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms