Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms