Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms