Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAPRE3Q9UPY8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAPRE3Q9UPY8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAPRE3Q9UPY8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAPRE3Q9UPY8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAPRE3Q9UPY8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MAPRE3Q9UPY8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms