Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SETD1BQ9UPS6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms