Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms