Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHMP5Q9NZZ3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms