Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM27Q9HBJ8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM27Q9HBJ8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms