Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BARHL1Q9BZE3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms